- Secretaría de Salud
- Administración del Patrimonio de la Beneficencia Pública
- Centro Nacional de la Transfusión Sanguínea
- Centro Nacional de Prevención y Control del VIH/SIDA
- Centro Nacional de Equidad de Género y Salud Reproductiva
- Comisión Nacional de Arbitraje Médico
- Servicios de Atención Psiquiátrica
- Centro Nacional de Programas Preventivos y Control de Enfermedades
- Centro Nacional de Trasplantes
- Centro Nacional para la Salud de la Infancia y la Adolescencia
- Centro Nacional de Excelencia Tecnológica en Salud
- Comisión Nacional de Bioética
- Comisión Nacional contra las Adicciones
- Instituto Nacional de Geriatría