• Dirección General de Programación y Presupuesto


• Dirección General de Coordinación de los Hospitales Federales de Referencia


• Dirección General de Calidad y Educación en Salud


• Dirección General de Recursos Materiales y Servicios Generales


• Secretariado Técnico del Consejo Nacional de Salud Mental


• Unidad Coordinadora de vinculación y Participación Social


• Consejo de Salubridad General


• Dirección General de Desarrollo de la Infraestructura Física


• Dirección General de Relaciones Internacionales


• Secretaría de Salud


• Dirección General Información en Salud


• Dirección General de Recursos Humanos y Organización


• Secretariado Técnico del Consejo Nacional para la Prevención de Accidentes (ST CONAPRA)

• Centro Nacional de Equidad de Género y Salud Reproductiva

• Centro Nacional de la Transfusión Sanguínea (CNTS).

• Centro Nacional para la Prevención y Control del VIH y el sida.

• Centro Nacional de Programas Preventivos y Control de Enfermedades (CENAPRECE)

• Comisión Nacional de Bioética

• Unidad de Administración y Finanzas

• Subsecretaría de Prevención y Promoción de la Salud